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负责机关日常运转，承担文秘、宣传、信息、政务公开、信访、会务、机要、保密、档案、安全、后勤、财务、资产、内部审计等工作，提出有关水利价格、税费、基金、信贷的建议。负责人大政协建议提案、领导重要批示件督办工作。

起草相关地方性法规、规章草案和规范性文件。负责行政复议、行政应诉等相关工作。研究拟订水利工作的综合性政策。组织指导水利行政许可工作。监督管理水政监察和水行政执法工作，协调跨区域水事纠纷，组织查处重大水事违法事件。组织指导水利法制宣传教育工作。